Kronik kompleks hastalıkların, erken safhada saptanması ve tedavisinde,bireye özgü temel biyolojik dengesizlikleri biyokimya moleküler biyoloji, fizyoloji, genetik, epigenetik, mikrobiyoloji gibi pekçok farklı bilim ışığında değerlendirerek, hastalığın altta yatan nedenlerini bulup, oluştuğu yoldan geri çevirmeyi amaçlayan yaklaşımdır.Fonksiyonel tıp yaklaşımında hastanın yiyecek seçimleri, enfeksiyon geçmişi, detoksifikasyon kapasitesi, mikrobiyata dengesi, mitokondriyal fonksiyonu, egzersiz paterni, nöroendokrin dengesi, hormonal dengesi, sosyal ilişkileri, stres yükü ve strese cevabı, sonuç olarak ana biyolojik sistemlerin fonksiyonları ve ilişkileri ayrı ayrı ve ayrıntılı olarak değerlendirilir. Modern tıpta (MT) hastada nasıl bir hastalık olduğu araştırılırken, Fonksiyonel tıpta (FT) hastalığın nasıl bir hastada olduğu araştırılır. MT da organ tedavi edilir, FT da organizmanın bütünü tedavi edilir. MT hastalığın yönetimine odaklıdır FT sağlığı korumaya ve geri kazanmaya odaklıdır.